母公司与子公司签订的合同，子公司实际使用是允许的。子公司是指被另一公司控制或依照协议实际控制、支配的具有法人资格的承担民事责任的公司。当母公司签订的合同被子公司实际使用时，一般会进行分别结算。
法律分析
母公司签的合同但是实际使用是子公司是可以的。子公司是指一定数额的股份被另一公司控制或依照协议被另一公司实际控制、支配的公司，具有法人资格，依法承担民事责任，当母公司签的合同被子公司实际使用时，母子公司一般是分别结算。
拓展延伸
母公司治理子公司：探索有效的管控策略与运作模式
母公司治理子公司是一个复杂而关键的议题。为了确保有效的管控策略与运作模式，母公司需要采取一系列措施。首先，建立清晰的组织结构和权责分明的管理体系，以确保信息流畅和决策高效。其次，制定明确的治理准则和规范，包括合规要求、财务监督和风险控制，以确保子公司的合规运营。此外，母公司应加强对子公司的监督与评估，定期进行绩效评估和风险评估，及时发现问题并采取纠正措施。同时，加强与子公司的沟通和协调，建立良好的合作关系，促进信息共享和协同工作。最后，母公司还应注重培养子公司的管理团队，提供培训和支持，以提升其管理能力和业务水平。通过以上措施的综合运用，母公司可以实现对子公司的有效管控，确保其正常运营并实现整体发展目标。
结语
母子公司签订合同并实际使用的情况下，一般会进行分别结算。母公司治理子公司需要建立清晰的组织结构和管理体系，制定明确的治理准则和规范，加强监督与评估，加强沟通和协调，培养子公司的管理团队。通过综合运用这些措施，母公司可以实现对子公司的有效管控，确保正常运营和整体发展目标的实现。
法律依据
《公司法》第十四条
公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。
公司可以设立子公司，子公司具有法人资格，依法承担民事责任。