法律规定员工自动离职单位也无权扣除工资。但是如果因员工擅自离职而给单位造成经济损失则应由离职者承担相应责任。
法律依据：
《中华人民共和国工资支付暂行规定》第九条 用人单位均应在解除合同之时一次性结清工资。
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