农村土地确权纠纷的处理方式有：
1.土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决;
2.协商不成的，由处理。
单位之间的争议，由县级以上处理;个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级或者县级以上处理。
3.当事人对有关的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民起诉。
【本文关联的相关法律依据】
《土地管理法》第十四条规定，土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由处理。
单位之间的争议，由县级以上处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级或者县级以上处理。
当事人对有关的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民起诉。
在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。