叶军的获得荣誉
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2011年，美国科学院院士。
2007年德国卡尔·蔡司研究奖
2007年度美国物理学会拉比奖
2006年度美国光学学会威廉·梅格斯奖(William F. Meggers Awards)
2006年度美国国家标准和技术局Stratton奖(Samuel Wesley Stratton Award)
2006年度德国亚历山大·冯·洪堡基金会析弗里德里希·威廉·贝塞尔研究奖(Friedrich Wilhem Bessel Research Award)
2006年，美国光学学会会士
2005年，技术发明一等奖
2005年，美国物理学会会士
2005年，美国联邦*颁发的阿瑟·弗莱明奖(Arthur S. Flemming Award)
2003年，美国总统科学和工程学早期职业奖
2002年，入选美国《技术评论杂志》100位顶尖年轻创新者
2001年，美国商业部金奖(团队)
1999 年度美国光学学会阿道夫·伦奖(Adolph Lomb Medal)
叶军的博士导师正是约翰·霍尔。
做博士是叶军科学生命中的重要一步。“回过头看，比较清晰的物理思想就是在博士阶段形成的。”叶军曾在接受《科学时报》采访时说，他在博士阶段最大的收获就是“干实事”。
据叶军介绍，霍尔是一位非常优秀的实验物理学家，他的伟大之处是让你相信，你能用自己的双手比别人做得更好。他常说的一句话是“他们能做，但我能做得更好”。
“我在他手下学到的一个最好品德是做事严谨，什么事都要想想人家为什么会那样做，我们能发现做得更好的新方法吗？”叶军说。
叶军1999年8月回到JILA，建立了自己的实验室，虽然是研究，但与约翰·霍尔博士有密切合作。几年前，霍尔退休时，叶军接管了他的实验室。他在霍尔的诺奖成就——解决光梳技术最关键的实验中发挥了极为重要的作用。
所谓的“光梳”是指拥有一系列频率均匀分布的光频谱，这些频谱仿佛一把梳子上的齿或一根尺子上的刻度，光梳可用于测定未知频谱的具体频率。1978年，汉斯首次提出光梳的概念，20世纪末，汉斯、霍尔、叶军及其他研究人员对光梳技术进行了有效改进，测量精度达小数点后15位。
叶军要更上一层楼，他和他的博士生、博士后们有一个共同目标：做世界上最好的原子钟。 2006年12月1日出版的《科学》杂志发表了他的研究小组的最新突破成就：《在1秒时间范围内光原子的共振》(optical atomic coherence at the 1-Second Time Scale)。美国《新科学家》杂志预言：(叶军的)这台锶原子钟将取代现存于NIST的铯原子钟，成为世界新的黄金计时标准。
卡尔·蔡司研究奖的网站这样评价叶军的锶原子钟：“从精度和稳定性看，他的测量装置是目前世界上测量光跃迁的锶原子钟中最领先的装置之一。专家们预测，这台钟测量时间的精度比目前保存在美国国家标准和技术局中的铯原子钟更准确……其准确率相当于7000万年差一秒。”
站在巨人的肩上，叶军有更大的梦想：“我在加州理工学院做博士后时受到不同风格的影响，受益很多。我的博士后导师吉夫·金博教授强调新思想和创造性思维。霍尔是很厉害的实验学家，金博是伟大的思想家，我希望自己能学到这两位导师最优秀的品质。这是每个人都可以有的梦想！”
